226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1643 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 393 aa  814    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  62.12 
 
 		 420 aa  472  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  59.61 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  60.66 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.45 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  57.42 
 
 		 416 aa  450  1e-125  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.93 
 
 		 427 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.62 
 
 		 436 aa  441  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  61.69 
 
 		 406 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  55.5 
 
 		 414 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
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NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.26 
 
 		 420 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.15 
 
 		 472 aa  425  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.76 
 
 		 413 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.3 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  54.87 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  54.87 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  54.87 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  54.87 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  54.87 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  54.79 
 
 		 457 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  54.6 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
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NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  54.62 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
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NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  54.87 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  54.87 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  54.87 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.6 
 
 		 472 aa  418  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  54.04 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.33 
 
 		 437 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.77 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.34 
 
 		 437 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.87 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.1 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.82 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.5 
 
 		 440 aa  408  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.22 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  51.82 
 
 		 375 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.8 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  52.8 
 
 		 453 aa  408  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  55.1 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.6 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  54.19 
 
 		 433 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.75 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.47 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  54.37 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.21 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.65 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  50.56 
 
 		 708 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  50.83 
 
 		 730 aa  395  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  49.08 
 
 		 527 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  52.1 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  51.8 
 
 		 730 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  50.97 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.9 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  50.98 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.56 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.26 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.56 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.43 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  51.14 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.86 
 
 		 413 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  49.18 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  48.31 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
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NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  45.61 
 
 		 412 aa  354  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.71 
 
 		 402 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.71 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  45.15 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.72 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.2 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.04 
 
 		 419 aa  339  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.88 
 
 		 381 aa  336  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.45 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.07 
 
 		 374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.86 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  48.3 
 
 		 344 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49 
 
 		 347 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.7 
 
 		 344 aa  316  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  46.69 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.67 
 
 		 346 aa  308  9e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.57 
 
 		 344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.15 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.57 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  43.96 
 
 		 360 aa  285  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  42.77 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  40.68 
 
 		 393 aa  275  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.27 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  40.88 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.43 
 
 		 350 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  39.46 
 
 		 340 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.88 
 
 		 350 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.68 
 
 		 356 aa  269  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.82 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  41.21 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  43.07 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  39.51 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.95 
 
 		 347 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  42.17 
 
 		 366 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
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NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.36 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  42.33 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.87 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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