225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2148 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 422 aa  875    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  67.07 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  66.67 
 
 		 419 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  63.88 
 
 		 432 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  61.5 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  62.24 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  58.37 
 
 		 422 aa  512  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  57.28 
 
 		 412 aa  505  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.43 
 
 		 408 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
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NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.21 
 
 		 407 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  50.42 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  46.56 
 
 		 420 aa  360  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  46.11 
 
 		 416 aa  356  5e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.79 
 
 		 422 aa  353  2e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  45.2 
 
 		 730 aa  348  7e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  44.92 
 
 		 730 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  44.92 
 
 		 708 aa  347  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.92 
 
 		 406 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  46.72 
 
 		 473 aa  345  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  46.72 
 
 		 473 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  46.72 
 
 		 473 aa  345  8e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  46.72 
 
 		 473 aa  345  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  46.72 
 
 		 473 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  46.72 
 
 		 473 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  46.72 
 
 		 473 aa  345  8e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  46.72 
 
 		 473 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.44 
 
 		 472 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.94 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  42.93 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  46.44 
 
 		 473 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  45.25 
 
 		 416 aa  341  1e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.03 
 
 		 436 aa  341  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.15 
 
 		 472 aa  340  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.29 
 
 		 437 aa  341  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  45.94 
 
 		 453 aa  338  9e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.73 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.81 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.13 
 
 		 433 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.85 
 
 		 433 aa  332  8e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.07 
 
 		 437 aa  332  8e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  43.02 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.45 
 
 		 393 aa  330  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.54 
 
 		 437 aa  329  7e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.18 
 
 		 454 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  43.02 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  42.36 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.55 
 
 		 415 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  44.15 
 
 		 375 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  42.09 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.55 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.18 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.7 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.3 
 
 		 437 aa  323  5e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.57 
 
 		 413 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  43.06 
 
 		 457 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.68 
 
 		 427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.13 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.68 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  42.78 
 
 		 454 aa  316  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.94 
 
 		 419 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  42.46 
 
 		 483 aa  313  4.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.4 
 
 		 346 aa  309  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.45 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  44.6 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  43.39 
 
 		 344 aa  299  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.22 
 
 		 411 aa  299  8e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  38.13 
 
 		 527 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.27 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.82 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.82 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  42.07 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.13 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.44 
 
 		 381 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.4 
 
 		 385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.92 
 
 		 374 aa  282  8.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.24 
 
 		 365 aa  278  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.86 
 
 		 341 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  39.64 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  39.64 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.76 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.76 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.94 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.81 
 
 		 358 aa  245  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0035  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.22 
 
 		 520 aa  246  8e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.36 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  34.93 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  37.58 
 
 		 349 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.07 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.15 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
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NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  39.56 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  34.47 
 
 		 364 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  35.88 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.87 
 
 		 347 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
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NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  37.42 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.58 
 
 		 345 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  35.28 
 
 		 340 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  32.63 
 
 		 397 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  36.79 
 
 		 366 aa  211  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
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NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.46 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.792489 
 
 
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