225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4018 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 360 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.92 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  55.52 
 
 		 353 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  55.42 
 
 		 344 aa  361  9e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.12 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.47 
 
 		 344 aa  339  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.47 
 
 		 344 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  54.04 
 
 		 347 aa  335  7e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.72 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.24 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.76 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.37 
 
 		 427 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  49.07 
 
 		 454 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  50 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  45.09 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.31 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.46 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.08 
 
 		 433 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  48.75 
 
 		 730 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  48.75 
 
 		 708 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.38 
 
 		 440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.71 
 
 		 433 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  47.81 
 
 		 730 aa  301  9e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  48.12 
 
 		 438 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.16 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  46.91 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.77 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.53 
 
 		 437 aa  299  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.94 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  42.66 
 
 		 414 aa  296  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.94 
 
 		 437 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  45.99 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  45.99 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  45.99 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  45.99 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  45.99 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  45.99 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  45.99 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  44.83 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  45.99 
 
 		 473 aa  296  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  48.36 
 
 		 420 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
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NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  45.68 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  49.35 
 
 		 416 aa  293  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  45.19 
 
 		 416 aa  293  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.68 
 
 		 472 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.68 
 
 		 472 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.59 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.73 
 
 		 454 aa  289  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.14 
 
 		 422 aa  288  9e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.48 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  44.08 
 
 		 527 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.51 
 
 		 393 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  44.06 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  50.17 
 
 		 483 aa  281  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.8 
 
 		 423 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  43.19 
 
 		 439 aa  279  5e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  43.19 
 
 		 439 aa  278  8e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.34 
 
 		 419 aa  278  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.28 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.9 
 
 		 460 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.64 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.83 
 
 		 419 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  47.04 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  37.93 
 
 		 422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.77 
 
 		 415 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.38 
 
 		 413 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.77 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  40.42 
 
 		 415 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.67 
 
 		 406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.69 
 
 		 420 aa  266  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  37.31 
 
 		 412 aa  265  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.51 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.35 
 
 		 408 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.98 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.08 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.24 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.58 
 
 		 432 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.4 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  48.11 
 
 		 402 aa  242  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.51 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.42 
 
 		 402 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.42 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.98 
 
 		 363 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.28 
 
 		 350 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.3 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  44.89 
 
 		 366 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  43.84 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  42.86 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.61 
 
 		 350 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.09 
 
 		 366 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.792489 
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  40.52 
 
 		 340 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.98 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  41.07 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.85 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.45 
 
 		 382 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
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NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.19 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
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NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  41.85 
 
 		 340 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  43.48 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
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