74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1221 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1221  putative amidase protein  100 
 
 		 149 aa  296  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  65.07 
 
 		 599 aa  187  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  70.08 
 
 		 601 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  68.5 
 
 		 601 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  59.54 
 
 		 601 aa  166  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  54.3 
 
 		 599 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  58.4 
 
 		 601 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  57.81 
 
 		 600 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  52.82 
 
 		 631 aa  143  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  58.4 
 
 		 588 aa  142  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  52.05 
 
 		 601 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  51.77 
 
 		 597 aa  140  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  55.12 
 
 		 599 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  57.14 
 
 		 614 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  57.03 
 
 		 621 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  47.3 
 
 		 598 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  53.54 
 
 		 596 aa  134  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  53.6 
 
 		 628 aa  133  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  55.12 
 
 		 596 aa  133  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  50 
 
 		 616 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  54.92 
 
 		 621 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  47.92 
 
 		 609 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  50.39 
 
 		 600 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  51.75 
 
 		 569 aa  130  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  51.56 
 
 		 604 aa  130  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  51.97 
 
 		 597 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  50.75 
 
 		 625 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  45.77 
 
 		 598 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1114  Urea carboxylase  50.75 
 
 		 248 aa  129  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1891  Urea carboxylase  50.75 
 
 		 248 aa  129  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  55.64 
 
 		 607 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  51.18 
 
 		 611 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  53.85 
 
 		 600 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  51.18 
 
 		 611 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  46.48 
 
 		 601 aa  127  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  49.3 
 
 		 609 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  47.89 
 
 		 624 aa  126  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  50.39 
 
 		 601 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  51.18 
 
 		 606 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  49.59 
 
 		 576 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  47.86 
 
 		 603 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  46.51 
 
 		 600 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  46.21 
 
 		 618 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  47.69 
 
 		 633 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  47.29 
 
 		 607 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  48.92 
 
 		 572 aa  117  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  41.06 
 
 		 604 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  43.7 
 
 		 609 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  55.74 
 
 		 565 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  46.46 
 
 		 589 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  51.59 
 
 		 569 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  50.41 
 
 		 623 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  49.59 
 
 		 623 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  41.33 
 
 		 604 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  40.77 
 
 		 600 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  40.3 
 
 		 590 aa  103  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  46.46 
 
 		 595 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  52.85 
 
 		 596 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1917  allophanate hydrolase  52.58 
 
 		 186 aa  98.2  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.691164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  49.11 
 
 		 554 aa  96.7  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03660  hypothetical protein  42.15 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4198  hypothetical protein  42.15 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  42.06 
 
 		 578 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  42.06 
 
 		 578 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  42.06 
 
 		 578 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  45.45 
 
 		 627 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  42.19 
 
 		 540 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03711  conserved hypothetical protein  42.11 
 
 		 117 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  44.83 
 
 		 553 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  36.92 
 
 		 1822 aa  89.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25110  hypothetical protein  36.69 
 
 		 456 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  39.86 
 
 		 620 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  37.04 
 
 		 603 aa  80.5  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2756  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.389703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>