70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25110 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25110  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  891    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4052  allophanate hydrolase  38.5 
 
 		 540 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  37.91 
 
 		 603 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1822  allophanate hydrolase  28.37 
 
 		 578 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1888  allophanate hydrolase  28.37 
 
 		 578 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1841  allophanate hydrolase  28.37 
 
 		 578 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  42.27 
 
 		 595 aa  109  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3670  amidase  33.99 
 
 		 627 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1595  allophanate hydrolase  39.88 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  34.23 
 
 		 572 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3887  allophanate hydrolase  34.87 
 
 		 553 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012688  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  32.88 
 
 		 565 aa  93.2  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  29.2 
 
 		 616 aa  88.2  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2726  amidase  33.88 
 
 		 588 aa  87.4  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6516  allophanate hydrolase  32.43 
 
 		 601 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  36.24 
 
 		 618 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5649  allophanate hydrolase  35.16 
 
 		 597 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0611258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  32.38 
 
 		 601 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  35.97 
 
 		 633 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  30.99 
 
 		 599 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  34.62 
 
 		 601 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1221  putative amidase protein  36.69 
 
 		 149 aa  81.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3802  allophanate hydrolase  28.76 
 
 		 599 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  28.71 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  31.16 
 
 		 607 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6104  allophanate hydrolase  29.28 
 
 		 601 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0470749  normal  0.373295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  29.65 
 
 		 631 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  31.86 
 
 		 624 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  30.84 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  29.82 
 
 		 604 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  30.95 
 
 		 590 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  30.91 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  30.77 
 
 		 604 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1891  Urea carboxylase  31.08 
 
 		 248 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1114  Urea carboxylase  31.08 
 
 		 248 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  33.85 
 
 		 601 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  29.65 
 
 		 589 aa  75.1  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1264  allophanate hydrolase  30.23 
 
 		 625 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0676461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  28.89 
 
 		 599 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  29.73 
 
 		 621 aa  71.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  30.94 
 
 		 600 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  26.76 
 
 		 596 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2026  allophanate hydrolase  32.31 
 
 		 620 aa  70.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00515842  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2607  allophanate hydrolase  30.05 
 
 		 601 aa  70.5  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  30.33 
 
 		 609 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  34.11 
 
 		 611 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  35.48 
 
 		 621 aa  69.7  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  34.96 
 
 		 576 aa  70.1  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  28.57 
 
 		 623 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  34.68 
 
 		 611 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0944  allophanate hydrolase  26.44 
 
 		 628 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  25.72 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2503  allophanate hydrolase  27.75 
 
 		 600 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5922  amidase  34.75 
 
 		 623 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  27.15 
 
 		 600 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  28.69 
 
 		 597 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  29.47 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  27.93 
 
 		 598 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3978  allophanate hydrolase  29.47 
 
 		 604 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  27.19 
 
 		 607 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  28.02 
 
 		 609 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  26.44 
 
 		 598 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  29.19 
 
 		 600 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2417  amidase  22.22 
 
 		 600 aa  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000764006  decreased coverage  0.000000752111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1418  allophanate hydrolase  27.03 
 
 		 609 aa  63.9  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  38.52 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  33.06 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2362  allophanate hydrolase  28.29 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  23.39 
 
 		 1822 aa  53.9  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1917  allophanate hydrolase  32.99 
 
 		 186 aa  47.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.691164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>