More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0065 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0065  HU family DNA-binding protein  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2029  histone family protein DNA-binding protein  32.29 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  34.44 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  33.33 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  33.33 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  33.68 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  30 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0125  histone-like DNA-binding protein  35.14 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3327  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.0697763 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0107  histone family protein DNA-binding protein  30.39 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000271858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2058  histone-like DNA-binding protein  30 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.954956  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1364  histone family protein DNA-binding protein  30 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  29.47 
 
 		 91 aa  57  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  32.32 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1967  histone family protein DNA-binding protein  30.93 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00606172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  29.47 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  32.32 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  34.74 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  28.89 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4236  histone family protein DNA-binding protein  27.08 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0920  histone family protein DNA-binding protein  32.5 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.417728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  29.47 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  30.53 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  29.47 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  30.53 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5215  histone family protein DNA-binding protein  31.08 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243034  normal  0.450992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  33.68 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  31.58 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0274  histone-like DNA-binding protein  31.58 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  28.42 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3482  histone family protein DNA-binding protein  31.58 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  28.42 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3356  histone-like DNA-binding protein  29.47 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.860208  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0804  DNA-binding protein HU  31.58 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.471879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  29.47 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  29.59 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  28.89 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  29.47 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1317  histone family protein DNA-binding protein  28.89 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0548  histone family protein DNA-binding protein  30.53 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  27.37 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  24.74 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  29.17 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0547  histone family protein DNA-binding protein  30.53 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  29.47 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  32.22 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  32.22 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1509  DNA-binding protein HU-beta  28.42 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000490467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  29.47 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  31.58 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  29.47 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  28.72 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1430  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000153062  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3325  histone family protein DNA-binding protein  30.53 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1090  histone family protein DNA-binding protein  26.32 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3817  histone family protein DNA-binding protein  30.53 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3761  histone family protein DNA-binding protein  30.53 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.768478 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0507  histone family protein DNA-binding protein  30.53 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0267079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3943  histone family protein DNA-binding protein  30.53 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09623  probable DNA-binding protein HU  30.53 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.355669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  28.42 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  28.89 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0967  histone family protein DNA-binding protein  32.91 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0548  HU family DNA-binding protein  30.53 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  28.42 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  29.9 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  27.37 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1225  DNA-binding protein HU  33.33 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.973909999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  28.89 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  27.37 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  27.37 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  27.37 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0121  DNA-binding protein HU  27.78 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  29.9 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1188  histone family protein DNA-binding protein  24.21 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  27.37 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0139  histone family protein DNA-binding protein  29.47 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  28.42 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  27.78 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0888  histone family protein DNA-binding protein  34.72 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0648  non-specific DNA-binding protein HBsu  28.89 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  32.89 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2696  histone family protein DNA-binding protein  32.81 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  27.37 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  26.32 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  28.42 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1533  histone family protein DNA-binding protein  31.58 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.753498  normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  28.42 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1866  histone family protein DNA-binding protein  31.58 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0187787  hitchhiker  0.00274705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  26.32 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2665  histone family protein DNA-binding protein  28.89 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00920373  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  26.32 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  26.32 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1584  DNA-binding protein HU family protein  29.47 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000100307  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  28.42 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  27.37 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>