More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2696 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2696  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 109 aa  226  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2029  histone family protein DNA-binding protein  42.5 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  47.3 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  49.38 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  44.87 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  47.37 
 
 		 100 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4039  HU family DNA-binding protein  50.85 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  43.75 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4749  histone-like DNA-binding protein  50.85 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2724  histone-like DNA-binding protein  44.16 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.032856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  43.21 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  39.51 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  39.51 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  41.86 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  42.5 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  45.21 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  40.54 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  40.54 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  39.51 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0867  histone family protein DNA-binding protein  53.57 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.6253e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1565  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  39.51 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  40.7 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1546  histone family protein DNA-binding protein  41.98 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.0402e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  44.59 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  41.25 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  43.37 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  43.21 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  44.44 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  41.46 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  41.38 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  44.87 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  44.16 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  48.44 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1430  histone family protein DNA-binding protein  38.64 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000153062  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  43.84 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  43.24 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  40.74 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  49.18 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_66  DNA-binding protein HU-alpha  42.31 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  52.54 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  40.7 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  39.53 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  45.45 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  39.53 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2245  putative integration host factor beta-subunit (ihf-beta) protein  42.86 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  34.15 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1281  integration host factor subunit alpha  45.31 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1967  histone family protein DNA-binding protein  37.84 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00606172  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  40.23 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5215  histone family protein DNA-binding protein  45.16 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243034  normal  0.450992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1166  integration host factor subunit alpha  47.54 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  41.38 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  39.77 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1641  integration host factor subunit alpha  45.31 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860546  normal  0.370826 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  42.47 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  41.89 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  46.77 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  46.77 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  39.51 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0125  histone-like DNA-binding protein  35 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  36.89 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1971  integration host factor subunit alpha  45.31 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  41.03 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1583  integration host factor subunit alpha  45.31 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1773  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.330159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4621  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1090  histone family protein DNA-binding protein  46.88 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0999  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  40 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1458  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1365  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1481  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0197  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.878199  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1090  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  38.27 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>