More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1188 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1188  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1584  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.532726  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  41.57 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  40.45 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  40 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  38.89 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1893  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.73585  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_002950  PG0121  DNA-binding protein HU  37.65 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022412 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  40 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  41.11 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  41.11 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  41.11 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  41.11 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  41.11 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  41.11 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  41.11 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  41.11 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  44.32 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  40 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  41.11 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1546  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.0402e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2215  histone family protein DNA-binding protein  40.7 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000076232  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  40 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  34.44 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  38.89 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  40 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0548  HU family DNA-binding protein  34.44 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  38.89 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  38.89 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2844  histone family protein DNA-binding protein  38.64 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303498  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  36.67 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  40.91 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  39.53 
 
 		 92 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  39.53 
 
 		 92 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  37.36 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  36.67 
 
 		 94 aa  66.6  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  40.7 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  36.67 
 
 		 94 aa  66.6  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  38.46 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  35.56 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3482  histone family protein DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  34.83 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0547  histone family protein DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3817  histone family protein DNA-binding protein  34.44 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2799  histone family protein DNA-binding protein  39.56 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3761  histone family protein DNA-binding protein  34.44 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.768478 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0507  histone family protein DNA-binding protein  34.44 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0267079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2651  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.532078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3249  histone-like DNA-binding protein  40.45 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0548  histone family protein DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3943  histone family protein DNA-binding protein  34.44 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3325  histone family protein DNA-binding protein  34.44 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  34.44 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1912  histone family protein DNA-binding protein  36.05 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2665  histone family protein DNA-binding protein  38.37 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00920373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  34.44 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1509  DNA-binding protein HU-beta  36.67 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000490467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  38.89 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  38.89 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  31.11 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3327  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.0697763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  35.56 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  36.67 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  37.21 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0139  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0975  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1013  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0981  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4242  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2248  nucleoid protein Hbs  38.2 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0990789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3224  histone family protein DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1084  histone-like DNA-binding protein  30 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.66671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>