More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3249 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3249  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 90 aa  178  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4401  nucleoid protein HU alpha subunit  68.54 
 
 		 90 aa  130  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.177499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70600  HU family DNA-binding protein  68.54 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6125  putative DNA-binding protein  67.42 
 
 		 90 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5600  nucleoid protein HU alpha subunit  66.29 
 
 		 91 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5472  DNA-binding protein HU family  65.17 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5027  histone-like DNA-binding protein  65.17 
 
 		 91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.705107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48480  histone-like DNA-binding protein  64.04 
 
 		 90 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.707299  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5361  histone family protein DNA-binding protein  69.66 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5313  histone family protein DNA-binding protein  67.42 
 
 		 99 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0463079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5222  histone family protein DNA-binding protein  67.42 
 
 		 99 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0160  histone family protein DNA-binding protein  67.42 
 
 		 99 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.982339  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3758  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.639339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  57.78 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  54.44 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  55.06 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  55.06 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  55.06 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  55.06 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  55.68 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  55.06 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  55.06 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  55.06 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  55.06 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  55.06 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  52.81 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  53.93 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  53.93 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  54.55 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  53.93 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1098  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00970005  hitchhiker  0.00000236625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  53.41 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  51.11 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  50.56 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  51.11 
 
 		 98 aa  94.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  51.11 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  94  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>