More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1912 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1912  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 88 aa  173  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  55.17 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  56.32 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  56.32 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  55.17 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  56.32 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  53.49 
 
 		 92 aa  94.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  53.49 
 
 		 92 aa  94.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  57.47 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  54.65 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  55.17 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  55.81 
 
 		 91 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  54.55 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  55.17 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  55.17 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  55.17 
 
 		 94 aa  90.1  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  55.17 
 
 		 94 aa  90.1  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  53.41 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  55.81 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2665  histone family protein DNA-binding protein  52.27 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00920373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3723  DNA-binding protein HU-beta  51.16 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  55.17 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1750  histone-like DNA-binding protein  51.16 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.519537  normal  0.0235988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3694  nucleoid protein HU beta subunit  51.16 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.566059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  53.41 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  50.57 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  50.57 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  50.57 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  51.72 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 94 aa  87  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  54.02 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  50.57 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  54.55 
 
 		 91 aa  85.9  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0548  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2593  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  52.87 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  51.16 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  51.72 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3482  histone family protein DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 90 aa  84.7  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1098  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00970005  hitchhiker  0.00000236625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0547  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0846  DNA-binding protein HU  49.43 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000034735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  49.43 
 
 		 90 aa  84.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  48.84 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  52.87 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  48.28 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  48.84 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  64.18 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>