More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0274 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0274  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 
94 aa  192  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0804  DNA-binding protein HU  97.87 
 
 
94 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.471879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  29.67 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  32.22 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  36.67 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0065  HU family DNA-binding protein  31.58 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  30 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  30.77 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  30 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  30.77 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0125  histone-like DNA-binding protein  32.5 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 
90 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  31.11 
 
 
90 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  32.58 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  28.89 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  28.89 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  32.58 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  28.89 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  31.82 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  29.67 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  28.89 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  32.58 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  28.89 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  33.33 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1430  histone family protein DNA-binding protein  32.56 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000153062  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  30.77 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  28.89 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  28.89 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  28.89 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  28.89 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  28.89 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  28.89 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  28.89 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  28.89 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  28.89 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  33.7 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  29.67 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  32.22 
 
 
90 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  29.67 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  30.12 
 
 
91 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  29.67 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  30 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  28.89 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  30 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1168  putative DNA binding protein  29.67 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  30 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12900  putative DNA binding protein  29.67 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  33.7 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  31.87 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  27.78 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1314  integration host factor, alpha subunit  26.6 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  30 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3359  histone-like DNA-binding protein HU-beta (NS1)  29.87 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  32.61 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  30 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  29.67 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  28.57 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  28.26 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  30 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  27.78 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  30 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3392  HU family DNA-binding protein  30.26 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000680811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  27.47 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1967  histone family protein DNA-binding protein  27.78 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00606172  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  36 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  31.87 
 
 
91 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2593  histone family protein DNA-binding protein  28.57 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  30 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  27.78 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1317  histone family protein DNA-binding protein  29.67 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2795  histone family protein DNA-binding protein  28.57 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  28.57 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  29.67 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  30 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  27.78 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  27.78 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  25 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  28.89 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1584  histone family protein DNA-binding protein  24.44 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.532726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  28.09 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0055  histone family protein DNA-binding protein  28.57 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0808808  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1388  DNA-binding protein HU, form N  28.57 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  27.78 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  27.78 
 
 
126 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  27.27 
 
 
91 aa  47  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  27.78 
 
 
90 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  25.81 
 
 
99 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2029  histone family protein DNA-binding protein  29.33 
 
 
95 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  30.77 
 
 
91 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  31.18 
 
 
93 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  27.78 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  28.89 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  30 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3723  DNA-binding protein HU-beta  27.78 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  30.77 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1750  histone-like DNA-binding protein  27.78 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.519537  normal  0.0235988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  27.78 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  30.34 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  33.78 
 
 
91 aa  47  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>