54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4531 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  599  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5864  hypothetical protein  48.23 
 
 
160 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5496  hypothetical protein  48.61 
 
 
164 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2136  hypothetical protein  41.55 
 
 
157 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0223041  normal  0.216384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4748  hypothetical protein  41.73 
 
 
156 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1609  hypothetical protein  40.94 
 
 
157 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003647  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  125  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3448  hypothetical protein  43.26 
 
 
161 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1186  hypothetical protein  41.36 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4619  hypothetical protein  38.62 
 
 
154 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1450  hypothetical protein  33.79 
 
 
160 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1853  hypothetical protein  35.86 
 
 
155 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8070  hypothetical protein  39.73 
 
 
161 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1417  hypothetical protein  35.62 
 
 
160 aa  99.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000666972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  40.87 
 
 
121 aa  99  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1319  hypothetical protein  36.54 
 
 
172 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314854  decreased coverage  0.00847169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0910  hypothetical protein  31.51 
 
 
148 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4209  hypothetical protein  32.52 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3528  hypothetical protein  36.9 
 
 
192 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  35.65 
 
 
121 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  36.45 
 
 
133 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  36.7 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  35.24 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  33.96 
 
 
118 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3966  hypothetical protein  28.12 
 
 
193 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  35.78 
 
 
130 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  35.78 
 
 
130 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  35.78 
 
 
130 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  35.51 
 
 
135 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  35.04 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  36.61 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  33.05 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  34.55 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  35.78 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  31.82 
 
 
122 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  34.86 
 
 
191 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  34.86 
 
 
128 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  37.84 
 
 
118 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  32.73 
 
 
123 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  36.04 
 
 
125 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  33.02 
 
 
120 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  29.36 
 
 
122 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  29.82 
 
 
121 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  32.08 
 
 
115 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  32.11 
 
 
122 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  31.19 
 
 
122 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  29.91 
 
 
121 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1832  isomerase  32.38 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.502851  normal  0.0147334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  32.11 
 
 
120 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  29.36 
 
 
122 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  26.36 
 
 
118 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9054  hypothetical protein  29.82 
 
 
125 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>