43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1591 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  253  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  58.33 
 
 		 121 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  55.56 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  54.55 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  52.89 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  52.07 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  51.3 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  47.9 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  51.28 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  50.44 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  47.46 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  49.14 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  50.88 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  47.46 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  46.83 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  46.83 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  46.83 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  44.92 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  44.09 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  46.97 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  47.06 
 
 		 191 aa  103  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  46.67 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  44.44 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  46.51 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  44.92 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  46.96 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  41.74 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  39.32 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  32.74 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  35.78 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.19 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  33.02 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.55 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  36.04 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  30.83 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  30.19 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  35.16 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0143933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  31.19 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0367  hypothetical protein  29.13 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0111901  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  32.23 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2287  hypothetical protein  26.21 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3809  hypothetical protein  22.94 
 
 		 119 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00485065  normal  0.359528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>