44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0861 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  93.13 
 
 		 132 aa  247  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  55.65 
 
 		 121 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  57.78 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  55.12 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  52.89 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  50.44 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  51.79 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  53.1 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  50.86 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  53.1 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  50.88 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  50.88 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  49.12 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  51.33 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  50.88 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  50.88 
 
 		 191 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  50.44 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  51.79 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  48.25 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  46.55 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  44.74 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  41.44 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  40.87 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  43.48 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  40.35 
 
 		 123 aa  87  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  38.94 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  34.86 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  36.61 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.09 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  33.06 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  32.46 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  33.03 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.8 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  34.48 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  32.48 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  31.3 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  26.23 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  28.03 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2287  hypothetical protein  25 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0367  hypothetical protein  28.81 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0111901  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9054  hypothetical protein  26.13 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7265  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>