41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2665 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  271  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  85.59 
 
 
133 aa  209  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  66.67 
 
 
130 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  66.67 
 
 
130 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  66.67 
 
 
130 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  55.46 
 
 
121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  61.6 
 
 
132 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  65.79 
 
 
191 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  63.79 
 
 
130 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  57.78 
 
 
132 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  64.04 
 
 
130 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  63.16 
 
 
128 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  57.63 
 
 
122 aa  140  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  50.83 
 
 
121 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  54.55 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  57.26 
 
 
121 aa  130  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  53.72 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  53.39 
 
 
122 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  51.69 
 
 
122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  49.59 
 
 
122 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  49.17 
 
 
122 aa  114  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  49.15 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  45.3 
 
 
120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  45.76 
 
 
121 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  45.3 
 
 
118 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  45.38 
 
 
123 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  43.7 
 
 
123 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  44.14 
 
 
122 aa  94  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  36.04 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  35.51 
 
 
291 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  33.91 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
326 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  36.28 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  31.25 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  27.59 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  33.61 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  27.73 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  30.65 
 
 
122 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1832  isomerase  30 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.502851  normal  0.0147334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3757  hypothetical protein  30.23 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0143933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6457  hypothetical protein  28.36 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.358358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>