25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1832 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1832  isomerase  100 
 
 		 137 aa  276  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.502851  normal  0.0147334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  32.28 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  34.96 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  31.4 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  30.09 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  31.62 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  32.23 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  32.38 
 
 		 291 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  31.4 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  28.79 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  27.87 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  31.25 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  30.36 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  30.36 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  30.83 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  31.71 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  30.36 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  30.36 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  35.09 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  29.46 
 
 		 130 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.5 
 
 		 326 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  25.93 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>