42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0780 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  247  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  50.83 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  48.46 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  49.59 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  51.79 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  47.9 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  45.38 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  47.9 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  43.22 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  46.61 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  44.44 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  42.61 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  40.68 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  40.68 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  40.68 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  43.7 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  39.83 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  39.66 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  39.02 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  40.16 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  39.83 
 
 		 191 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  40.83 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  38.26 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  40.34 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  35.83 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  36.67 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  36.75 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.56 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  29.2 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  33.03 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.32 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  35.42 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3757  hypothetical protein  33.98 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0143933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  31.25 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  29.91 
 
 		 291 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  24.14 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  29.7 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  27.72 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  27.64 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1832  isomerase  28.57 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.502851  normal  0.0147334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9054  hypothetical protein  25.86 
 
 		 125 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>