30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4016 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  43.38 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  35.09 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7265  hypothetical protein  35.43 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  32.23 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  33.06 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  31.45 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  28.21 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  25.22 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  24.17 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  28 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  32.2 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6457  hypothetical protein  28.26 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  25.21 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  26.45 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  27.27 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  27.27 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  28.93 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  27.27 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  32.23 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  28.1 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  27.73 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  28.93 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  30.65 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  24.58 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  27.83 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  27.64 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  25.83 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  26.85 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>