41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5201 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  263  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  95.31 
 
 		 130 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  91.47 
 
 		 130 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  91.47 
 
 		 130 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  91.47 
 
 		 130 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  89.92 
 
 		 128 aa  234  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  89.39 
 
 		 191 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  70.69 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  65.29 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  66.1 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  63.79 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  57.26 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  51.75 
 
 		 121 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  51.33 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  50.88 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  49.54 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  50.42 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  46.97 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  46.15 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  39.83 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  41.74 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  43.22 
 
 		 123 aa  90.1  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  42.98 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  40.71 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  38.02 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  35.96 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  38.74 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  40.19 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  34.21 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  35.04 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.13 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  32.14 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  29.84 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.32 
 
 		 326 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  29.51 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  28.93 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5809  hypothetical protein  31.13 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  28.95 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  32.17 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1832  isomerase  29.46 
 
 		 137 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.502851  normal  0.0147334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>