24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0109 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  248  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  35.83 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  36.28 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  32.48 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  36.36 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  32.48 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  31.25 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  29.91 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  31.19 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  32.11 
 
 		 291 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  32.14 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  33.33 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  33.04 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  33.04 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  33.04 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  34.45 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  31.62 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  32.17 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  27.78 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  31.25 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  31.25 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  31.25 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  29.36 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  29.25 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>