42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0926 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  263  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  93.13 
 
 		 132 aa  247  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  54.78 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  61.6 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  59.5 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  52.07 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  50.44 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  49.12 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  52.21 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  53.98 
 
 		 122 aa  120  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  50.88 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  50.88 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  50.88 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  50.43 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  50.88 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  50.88 
 
 		 191 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  52.5 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  53.57 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  50 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  45.69 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  42.34 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  42.98 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  44.35 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  39.13 
 
 		 123 aa  88.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  38.6 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  39.82 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  33.03 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  31.45 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  35.71 
 
 		 291 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 326 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  33.94 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  31.62 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  32.48 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  31.3 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  26.02 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  27.69 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2287  hypothetical protein  25.69 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0367  hypothetical protein  27.19 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0111901  normal  0.419772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>