39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8209 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  42.24 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  40 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  36.21 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  37.17 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  35.78 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  39.81 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  36.36 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  36.61 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  32.46 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  33.64 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  33.03 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  33.94 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  33.94 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  33.03 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  33.04 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  33.93 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  29.63 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  33.04 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  32.14 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  32.14 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  32.14 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  31.9 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  32.14 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  31.53 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  31.25 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  34.23 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  34.26 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  32.08 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 326 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.32 
 
 		 334 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  31.43 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  31.3 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2287  hypothetical protein  30 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0367  hypothetical protein  32.43 
 
 		 115 aa  48.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0111901  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3757  hypothetical protein  31.68 
 
 		 132 aa  42  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0143933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>