47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1185 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  243  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  60.68 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  49.59 
 
 		 123 aa  130  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  50.83 
 
 		 123 aa  127  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  53.85 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  51.67 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  55 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  49.59 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  49.59 
 
 		 135 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  48.76 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  52.5 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  50.86 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  47.46 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  44.26 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  47.11 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  47.93 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  49.18 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  47.06 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  46.15 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  47.01 
 
 		 191 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  47.01 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  47.01 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  47.01 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  43.7 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  45.22 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  40.34 
 
 		 118 aa  90.5  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  42.24 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  36.28 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  37.29 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.04 
 
 		 326 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  32.23 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  34.55 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0367  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0111901  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.73 
 
 		 334 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  29.57 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2287  hypothetical protein  35.05 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  31.4 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3757  hypothetical protein  36.89 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0143933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  29.46 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  30.83 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  32.14 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6457  hypothetical protein  32.35 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5809  hypothetical protein  29.13 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1832  isomerase  27.87 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.502851  normal  0.0147334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7265  hypothetical protein  30.17 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>