42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5021 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  100 
 
 		 122 aa  246  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  60.68 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  57.27 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  55.56 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  51.69 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  51.69 
 
 		 123 aa  124  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  53.04 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  53.1 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  51.26 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  52.73 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  50.85 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  51.28 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  47.9 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  42.37 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  47.32 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  49.11 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  48.25 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  49.57 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  42.61 
 
 		 191 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  41.74 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  41.74 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  41.74 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  41.74 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  41.96 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  41.74 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  42.34 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  39.81 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  29.82 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  39.08 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0367  hypothetical protein  36.54 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0111901  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2287  hypothetical protein  30.43 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  32.11 
 
 		 291 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.35 
 
 		 326 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  31.13 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  35.37 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  32.5 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1832  isomerase  28.79 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.502851  normal  0.0147334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  27.83 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  28.04 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3757  hypothetical protein  33.65 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0143933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>