41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3410 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  259  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  90 
 
 
130 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  89.92 
 
 
130 aa  234  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  90 
 
 
130 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  90 
 
 
130 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  88.46 
 
 
130 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  88.72 
 
 
191 aa  230  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  68.64 
 
 
122 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  68.64 
 
 
122 aa  168  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  66.94 
 
 
122 aa  166  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  58.82 
 
 
133 aa  143  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  63.16 
 
 
135 aa  141  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  50.88 
 
 
121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  50.44 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  48.62 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  44.09 
 
 
125 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  48.72 
 
 
121 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  45.22 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  39.66 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  41.96 
 
 
122 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  41.88 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  42.61 
 
 
123 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  40.71 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  38.74 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  35.09 
 
 
121 aa  84.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  39.25 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  36.97 
 
 
122 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  34.48 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  34.86 
 
 
291 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  33.04 
 
 
115 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  30.58 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.56 
 
 
334 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.44 
 
 
326 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  27.27 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  33.04 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  28.33 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1832  isomerase  30.83 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.502851  normal  0.0147334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5809  hypothetical protein  30 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  25.83 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  27.68 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>