33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4095 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  71.9 
 
 		 122 aa  183  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0367  hypothetical protein  35.96 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0111901  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3757  hypothetical protein  33.93 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0143933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  33.02 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2287  hypothetical protein  30.7 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  34.23 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  31.3 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  31.3 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  30.7 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  31.4 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  29.63 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  31.13 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  29.63 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  29.63 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  29.63 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  31.48 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  29.51 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  29.51 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  32.11 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  25.93 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  28.81 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  29.7 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  28.33 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  27.88 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  25.86 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  29.52 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.24 
 
 		 334 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  33.02 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.76 
 
 		 326 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3809  hypothetical protein  25.21 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00485065  normal  0.359528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>