41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0103 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  100 
 
 		 122 aa  246  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  53.1 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  50.83 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  46.28 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  43.33 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  44.26 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  43.59 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  42.5 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  44.74 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  39.34 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  40.83 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  40.34 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  44.14 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  42.98 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  44.14 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  40.87 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  39.34 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  40.34 
 
 		 191 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  39.32 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  38.02 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  38.02 
 
 		 130 aa  84.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  37.61 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  37.61 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  37.61 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  37.82 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  36.97 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  36.67 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  36.97 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  33.04 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  31.82 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1832  isomerase  34.96 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.502851  normal  0.0147334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  31.9 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  29.13 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  28.21 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6457  hypothetical protein  32.03 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  33.02 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4611  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.15 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.32 
 
 		 334 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>