43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0592 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  266  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  85.59 
 
 		 135 aa  209  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  58.06 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  58.06 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  58.06 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  58.82 
 
 		 128 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  57.26 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  57.26 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  60.87 
 
 		 191 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  59.5 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  55.36 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  55.12 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  48.46 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  54.7 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  54.55 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  55.08 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  55.08 
 
 		 122 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  51.3 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  52.73 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  50.86 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  49.15 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  45.13 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  48.28 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  46.55 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  46.43 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  46.15 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  44.63 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  40.34 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  35.96 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  36.45 
 
 		 291 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  36.61 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  35.34 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.09 
 
 		 326 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.66 
 
 		 334 aa  58.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  26.5 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  37.04 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  28.91 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  28 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6457  hypothetical protein  27.54 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1832  isomerase  35.09 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.502851  normal  0.0147334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3757  hypothetical protein  31.58 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0143933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>