39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4550 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  246  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  94.17 
 
 		 122 aa  233  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  76.47 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  68.64 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  66.95 
 
 		 130 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  66.95 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  66.95 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  66.95 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  66.1 
 
 		 130 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  68.97 
 
 		 191 aa  163  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  54.55 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  53.72 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  47.5 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  53.98 
 
 		 132 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  53.1 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  49.14 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  49.11 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  47.06 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  47.75 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  42.61 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  44.25 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  47.11 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  45.45 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  41.18 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  43.8 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  40 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  41.96 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  34.23 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  36.75 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  31.36 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1832  isomerase  31.4 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.502851  normal  0.0147334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  33.62 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  27.93 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  31.19 
 
 		 291 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.62 
 
 		 326 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  24.58 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  27.78 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6457  hypothetical protein  30.51 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  26.89 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>