42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2203 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  79.17 
 
 		 123 aa  202  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  55.83 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  50.83 
 
 		 122 aa  127  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  49.17 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  48.33 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  50.85 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  46.61 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  47.46 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  42.5 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  48.76 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  44.17 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  46.15 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  45.38 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  47.11 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  40.17 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  47.11 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  40.87 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  43.86 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  43.86 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  43.86 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  42.98 
 
 		 191 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  39.13 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  42.98 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  43.86 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  35.83 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  41.88 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  38.84 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  37.72 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  37.17 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  33.61 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 		 326 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  26.98 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6457  hypothetical protein  30.88 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.17 
 
 		 334 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  31.25 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  25.22 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0367  hypothetical protein  32.38 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0111901  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2287  hypothetical protein  28.57 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5809  hypothetical protein  23.73 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3809  hypothetical protein  24.56 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00485065  normal  0.359528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>