21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2287 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2287  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  236  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0367  hypothetical protein  68.7 
 
 		 115 aa  164  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0111901  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5809  hypothetical protein  38.79 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3757  hypothetical protein  36.84 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0143933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  35.05 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.24 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  31.25 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  30.43 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  30.7 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  30.69 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  29.73 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  30 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 		 334 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  28.57 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  25.71 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  27.18 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  25.69 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  26.21 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  27.18 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>