20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3757 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3757  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  257  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0143933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0367  hypothetical protein  44.55 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0111901  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2287  hypothetical protein  36.84 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  33.93 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.04 
 
 
326 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  31.25 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  33.98 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  36.89 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.7 
 
 
334 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  30.63 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5809  hypothetical protein  32.48 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  31.3 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  33.01 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  33.65 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  31.58 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  31.68 
 
 
115 aa  42  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  29.25 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  30.1 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>