43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2062 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  79.17 
 
 		 123 aa  202  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  49.59 
 
 		 122 aa  130  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  53.72 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  52.07 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  51.69 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  45.45 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  50 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  43.33 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  44.63 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  43.7 
 
 		 135 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  44.92 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  42.5 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  44.63 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  45.22 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  39.67 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  44.07 
 
 		 130 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  44.07 
 
 		 130 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  44.07 
 
 		 130 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  43.8 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  43.22 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  42.37 
 
 		 191 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  43.22 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  42.61 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  40.35 
 
 		 132 aa  87  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  36.67 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  39.17 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  38.6 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  36.21 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  34.45 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.5 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  31.62 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  32.73 
 
 		 291 aa  60.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  26.19 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6457  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  24.17 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.43 
 
 		 334 aa  50.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0367  hypothetical protein  30.48 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0111901  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5809  hypothetical protein  24.77 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2287  hypothetical protein  25.71 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3809  hypothetical protein  26.32 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00485065  normal  0.359528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3757  hypothetical protein  29.25 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0143933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>