43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4645 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  250  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0863  hypothetical protein  76.23 
 
 
122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.845783  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  76.47 
 
 
122 aa  191  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4956  hypothetical protein  72.41 
 
 
130 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953896  decreased coverage  0.00795242 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5313  hypothetical protein  72.41 
 
 
130 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3054  hypothetical protein  72.41 
 
 
130 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5201  hypothetical protein  70.69 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.498194  normal  0.131879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4673  hypothetical protein  70.43 
 
 
130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0334  hypothetical protein  70.69 
 
 
191 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3410  hypothetical protein  68.64 
 
 
128 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180819  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  57.63 
 
 
135 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  54.7 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0926  hypothetical protein  49.12 
 
 
132 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  0.542017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0861  hypothetical protein  49.12 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183728  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2128  hypothetical protein  45.9 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0380535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1591  hypothetical protein  50.88 
 
 
125 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  47.11 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  45.13 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5021  isomerase  47.32 
 
 
122 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.06469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  47.11 
 
 
123 aa  100  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2790  hypothetical protein  42.48 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469064  normal  0.815337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  43.48 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  45.22 
 
 
123 aa  96.7  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0780  hypothetical protein  39.02 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.943434  hitchhiker  0.00271356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  40.87 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6072  isomerase  42.24 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8292  hypothetical protein  36.97 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.963382  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5036  isomerase  41.67 
 
 
118 aa  84.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3706  hypothetical protein  32.43 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.390395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  32.2 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.43 
 
 
326 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8209  hypothetical protein  33.04 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3421  hypothetical protein  28.83 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  29.36 
 
 
291 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.55 
 
 
334 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  25.21 
 
 
128 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1832  isomerase  32.5 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.502851  normal  0.0147334 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4095  hypothetical protein  28.81 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.779077  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0707  hypothetical protein  26.72 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.062855  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0109  hypothetical protein  31.62 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6457  hypothetical protein  28.03 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5809  hypothetical protein  23.81 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  25.2 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>