15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6457 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6457  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  296  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0084  hypothetical protein  43.48 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5770  hypothetical protein  37.31 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2203  hypothetical protein  30.88 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  32.03 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5682  hypothetical protein  30.88 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.768599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2062  hypothetical protein  28.68 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4016  hypothetical protein  28.26 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1185  hypothetical protein  32.35 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0592  hypothetical protein  27.54 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7265  hypothetical protein  29.29 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0771  hypothetical protein  27.01 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.605985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4645  hypothetical protein  28.03 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2665  hypothetical protein  28.36 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4550  hypothetical protein  30.51 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>