19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1319 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1319  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  356  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314854  decreased coverage  0.00847169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8070  hypothetical protein  48.97 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4748  hypothetical protein  44.06 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3448  hypothetical protein  43.45 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2136  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  124  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0223041  normal  0.216384 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003647  hypothetical protein  39.01 
 
 		 148 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1450  hypothetical protein  36.43 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4619  hypothetical protein  35.46 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1186  hypothetical protein  40.69 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1853  hypothetical protein  36.43 
 
 		 155 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5496  hypothetical protein  38.67 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1417  hypothetical protein  38.85 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000666972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1609  hypothetical protein  36.17 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5864  hypothetical protein  40.58 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  36.54 
 
 		 291 aa  97.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0910  hypothetical protein  32.85 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3966  hypothetical protein  27.81 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3528  hypothetical protein  29.45 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4209  hypothetical protein  34.67 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>