19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1450 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1450  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  330  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003647  hypothetical protein  59.46 
 
 		 148 aa  197  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1853  hypothetical protein  58.45 
 
 		 155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4748  hypothetical protein  54.17 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2136  hypothetical protein  54.29 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0223041  normal  0.216384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3448  hypothetical protein  50.34 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4619  hypothetical protein  46.15 
 
 		 154 aa  153  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1609  hypothetical protein  47.14 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5496  hypothetical protein  41.96 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5864  hypothetical protein  42.07 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1186  hypothetical protein  36.13 
 
 		 183 aa  122  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8070  hypothetical protein  40.28 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  33.79 
 
 		 291 aa  114  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1319  hypothetical protein  36.43 
 
 		 172 aa  113  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314854  decreased coverage  0.00847169 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1417  hypothetical protein  35.76 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000666972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0910  hypothetical protein  35.03 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3966  hypothetical protein  32.89 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3528  hypothetical protein  43.75 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4209  hypothetical protein  26.32 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>