19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2136 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2136  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  323  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0223041  normal  0.216384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4748  hypothetical protein  61.22 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5496  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  170  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3448  hypothetical protein  51.7 
 
 		 161 aa  164  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1450  hypothetical protein  54.29 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1609  hypothetical protein  53.1 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4619  hypothetical protein  42.76 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003647  hypothetical protein  47.52 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1853  hypothetical protein  46.81 
 
 		 155 aa  148  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1186  hypothetical protein  47.06 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5864  hypothetical protein  46.53 
 
 		 160 aa  143  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  41.55 
 
 		 291 aa  138  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1417  hypothetical protein  43.06 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000666972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8070  hypothetical protein  43.92 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1319  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314854  decreased coverage  0.00847169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0910  hypothetical protein  37.23 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3528  hypothetical protein  41.77 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3966  hypothetical protein  32.26 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4209  hypothetical protein  29.27 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>