20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003647 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003647  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1853  hypothetical protein  64.58 
 
 
155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1450  hypothetical protein  59.46 
 
 
160 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4748  hypothetical protein  50.34 
 
 
156 aa  157  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2136  hypothetical protein  47.52 
 
 
157 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0223041  normal  0.216384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3448  hypothetical protein  50 
 
 
161 aa  145  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4619  hypothetical protein  44.06 
 
 
154 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1609  hypothetical protein  47.86 
 
 
157 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5864  hypothetical protein  46.76 
 
 
160 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  40 
 
 
291 aa  125  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5496  hypothetical protein  41.84 
 
 
164 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8070  hypothetical protein  42.66 
 
 
161 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1186  hypothetical protein  38.93 
 
 
183 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1319  hypothetical protein  39.01 
 
 
172 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314854  decreased coverage  0.00847169 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1417  hypothetical protein  35.46 
 
 
160 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000666972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0910  hypothetical protein  33.57 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4209  hypothetical protein  31.33 
 
 
180 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3966  hypothetical protein  31.58 
 
 
193 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3528  hypothetical protein  26.8 
 
 
192 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0614  hypothetical protein  30.21 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.941975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>