19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1853 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1853  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  320  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003647  hypothetical protein  64.58 
 
 		 148 aa  198  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1450  hypothetical protein  58.45 
 
 		 160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4748  hypothetical protein  53.9 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3448  hypothetical protein  51.43 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2136  hypothetical protein  46.81 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0223041  normal  0.216384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1609  hypothetical protein  50.71 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4619  hypothetical protein  44.76 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5864  hypothetical protein  43.88 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5496  hypothetical protein  39.01 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1186  hypothetical protein  38.96 
 
 		 183 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  35.86 
 
 		 291 aa  114  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8070  hypothetical protein  37.24 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1319  hypothetical protein  36.43 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314854  decreased coverage  0.00847169 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1417  hypothetical protein  36.11 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000666972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0910  hypothetical protein  34.31 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4209  hypothetical protein  27.54 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3528  hypothetical protein  28.83 
 
 		 192 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3966  hypothetical protein  28.21 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>