19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5864 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5864  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  326  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5496  hypothetical protein  50.35 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  47.26 
 
 		 291 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2136  hypothetical protein  46.53 
 
 		 157 aa  143  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0223041  normal  0.216384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1609  hypothetical protein  46.15 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003647  hypothetical protein  46.76 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3448  hypothetical protein  48.91 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1853  hypothetical protein  42.47 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4748  hypothetical protein  42.55 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1450  hypothetical protein  41.78 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1186  hypothetical protein  44 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4619  hypothetical protein  37.84 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1417  hypothetical protein  39.86 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000666972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1319  hypothetical protein  40.58 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314854  decreased coverage  0.00847169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8070  hypothetical protein  37.24 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0910  hypothetical protein  34.31 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3966  hypothetical protein  31.61 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4209  hypothetical protein  29.09 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3528  hypothetical protein  31.1 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.7892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>