24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0910 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0910  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3448  hypothetical protein  39.44 
 
 		 161 aa  95.9  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003647  hypothetical protein  33.57 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2136  hypothetical protein  37.23 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0223041  normal  0.216384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1450  hypothetical protein  35.03 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1853  hypothetical protein  34.31 
 
 		 155 aa  90.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5496  hypothetical protein  38.85 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4619  hypothetical protein  34.11 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  31.51 
 
 		 291 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4748  hypothetical protein  36.17 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5864  hypothetical protein  34.31 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  84.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1609  hypothetical protein  35.25 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1319  hypothetical protein  32.85 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314854  decreased coverage  0.00847169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8070  hypothetical protein  31.62 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1417  hypothetical protein  31.91 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000666972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3528  hypothetical protein  40 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4209  hypothetical protein  31.48 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3966  hypothetical protein  28.78 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1802  hypothetical protein  29.27 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1855  jemb  30.86 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.449956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1746  hypothetical protein  30.86 
 
 		 111 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1566  hypothetical protein  29.27 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>