19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4748 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4748  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  325  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2136  hypothetical protein  61.22 
 
 
157 aa  194  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0223041  normal  0.216384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3448  hypothetical protein  55.26 
 
 
161 aa  183  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1450  hypothetical protein  54.17 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1853  hypothetical protein  53.9 
 
 
155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003647  hypothetical protein  50.34 
 
 
148 aa  157  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28555  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5496  hypothetical protein  47.97 
 
 
164 aa  157  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1609  hypothetical protein  50.68 
 
 
157 aa  150  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4619  hypothetical protein  45.7 
 
 
154 aa  148  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  41.73 
 
 
291 aa  133  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1319  hypothetical protein  44.06 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314854  decreased coverage  0.00847169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5864  hypothetical protein  42.55 
 
 
160 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8070  hypothetical protein  42.76 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1186  hypothetical protein  38.31 
 
 
183 aa  120  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1417  hypothetical protein  40.14 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000666972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0910  hypothetical protein  36.17 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4209  hypothetical protein  29.89 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3966  hypothetical protein  28.3 
 
 
193 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3528  hypothetical protein  36.71 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.7892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>