20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5496 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5496  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2136  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0223041  normal  0.216384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3448  hypothetical protein  54 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4748  hypothetical protein  47.97 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5864  hypothetical protein  50.35 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  48.61 
 
 		 291 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1609  hypothetical protein  47.3 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4619  hypothetical protein  40.79 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1450  hypothetical protein  41.96 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1853  hypothetical protein  39.01 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003647  hypothetical protein  41.84 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28555  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1186  hypothetical protein  41.4 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8070  hypothetical protein  42.28 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1417  hypothetical protein  42.66 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000666972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1319  hypothetical protein  38.67 
 
 		 172 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314854  decreased coverage  0.00847169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0910  hypothetical protein  38.85 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3966  hypothetical protein  34.19 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3528  hypothetical protein  33.97 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4209  hypothetical protein  30.86 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0614  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.941975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>