19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3448 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3448  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  330  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4748  hypothetical protein  55.26 
 
 
156 aa  183  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5496  hypothetical protein  54 
 
 
164 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1609  hypothetical protein  53.42 
 
 
157 aa  168  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2136  hypothetical protein  51.7 
 
 
157 aa  164  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0223041  normal  0.216384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1853  hypothetical protein  51.43 
 
 
155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1450  hypothetical protein  50.34 
 
 
160 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003647  hypothetical protein  50 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5864  hypothetical protein  48.91 
 
 
160 aa  133  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4619  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166166  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1319  hypothetical protein  43.45 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314854  decreased coverage  0.00847169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1186  hypothetical protein  43.14 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4531  hypothetical protein  43.26 
 
 
291 aa  124  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8070  hypothetical protein  42.76 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1417  hypothetical protein  38.73 
 
 
160 aa  98.2  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000666972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0910  hypothetical protein  39.44 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3966  hypothetical protein  35.03 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4209  hypothetical protein  30.95 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3528  hypothetical protein  33.12 
 
 
192 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.7892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>