More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4009 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4009  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  510  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.153602  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  46.35 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  44.3 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  44.3 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  42.24 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  46.55 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  43.88 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  42.8 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  45.8 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  42.19 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  46.98 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  42.37 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  44.49 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  44.44 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  47.41 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  40.43 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  46.98 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  44.44 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  44.07 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  41.45 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  42.49 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  45.06 
 
 		 238 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  44.21 
 
 		 235 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  40.43 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  46.78 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  42.74 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.48 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  45.08 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  44.54 
 
 		 245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6492  ABC transporter related  44.96 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0130202  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  39.91 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  41.2 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  43.46 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  42.8 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  42.44 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  40.17 
 
 		 237 aa  195  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  41.98 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  42.86 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  41.53 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0865  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.3 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0314123  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  42.8 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3396  ABC transporter related  43.7 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0282544 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  40.34 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 233 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  46.96 
 
 		 234 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  43.21 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  41.63 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  42.13 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  42.13 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  44.68 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  46.32 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 247 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  39.41 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  43.28 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  43.97 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  40.77 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  40.68 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.97 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  41.45 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  42.86 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  40 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  41.03 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  41.98 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.69 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  42.98 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  39.66 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  42.67 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  39.74 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  42.92 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  43.35 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  41.1 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  42.02 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  41.95 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  42.24 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  44.81 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.32 
 
 		 244 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  43.3 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1158  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  41.63 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  44.64 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0774  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 232 aa  188  8e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.937029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  41.87 
 
 		 247 aa  188  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 		 237 aa  188  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  40.74 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  42.32 
 
 		 244 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  42.37 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  37.34 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  40.51 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  37.34 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  42.67 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>