More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1031 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1031  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3114  hypothetical protein  55.14 
 
 		 340 aa  311  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.57 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.58 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.14 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.53 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.8 
 
 		 330 aa  212  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.8 
 
 		 330 aa  212  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.55 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.2 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.2 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.8 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.31 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  39.93 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.54 
 
 		 324 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.21 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  38.73 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.46 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.07 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.46 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.75 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.42 
 
 		 328 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.55 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.46 
 
 		 328 aa  198  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.8 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.54 
 
 		 335 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.86 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  39.46 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.27 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.83 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.29 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.8 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  37.46 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  35.22 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  36.7 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.76 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  37.92 
 
 		 338 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.39 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  38.8 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  38.64 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.18 
 
 		 328 aa  192  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  35.84 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.2 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  38.18 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  34.48 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.36 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  39.6 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  34.37 
 
 		 331 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.33 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  37.07 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  39.31 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  37.76 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.13 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.65 
 
 		 336 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  36.51 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  34.92 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.19 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  37.29 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  34.33 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  36.09 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  34.46 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.91 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  37.04 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  37.62 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  34.64 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.44 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38.51 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  37.71 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.3 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  36.06 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  37.92 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  36.82 
 
 		 322 aa  185  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  37.71 
 
 		 317 aa  185  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  36.82 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.25 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  37 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  38.59 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  37.5 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.7 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  36.49 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.69 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0838  hypothetical protein  38.98 
 
 		 332 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0037307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.15 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  35.71 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  35.81 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  37.04 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  36.15 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.15 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  32.93 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38.94 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  37.84 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  37.97 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  39.12 
 
 		 362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  36.73 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  38.51 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  37.37 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  38.21 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  35.47 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>