More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1173 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  81.57 
 
 		 442 aa  718    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 435 aa  861    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  81.34 
 
 		 435 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  82.05 
 
 		 458 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  81.11 
 
 		 442 aa  687    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  80.88 
 
 		 442 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  81.57 
 
 		 435 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  80.88 
 
 		 442 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  81.76 
 
 		 435 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  81.99 
 
 		 435 aa  708    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  80.88 
 
 		 442 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  81.57 
 
 		 435 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  79.43 
 
 		 439 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  69.77 
 
 		 430 aa  589  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  67.44 
 
 		 435 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  69.88 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  66.67 
 
 		 434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  70.34 
 
 		 470 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  70.1 
 
 		 435 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  70.1 
 
 		 435 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  70.1 
 
 		 435 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  70.1 
 
 		 472 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  70.1 
 
 		 435 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  70.1 
 
 		 435 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  70.1 
 
 		 435 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  69.36 
 
 		 432 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  69.36 
 
 		 432 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  69.12 
 
 		 432 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  65.49 
 
 		 427 aa  528  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  59.49 
 
 		 438 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  60.51 
 
 		 439 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  62.59 
 
 		 426 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  59.37 
 
 		 433 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  58.44 
 
 		 437 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  55.93 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  57.43 
 
 		 490 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  59.11 
 
 		 421 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  54.38 
 
 		 453 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  55.77 
 
 		 436 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  58.56 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  56.22 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  53.99 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  54.79 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  52.18 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  56.36 
 
 		 429 aa  428  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  53.06 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  55.89 
 
 		 412 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  53.06 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  55.78 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  56.16 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  54.48 
 
 		 434 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  51.9 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  55.28 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  53.15 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  56.68 
 
 		 409 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  53.77 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  53.25 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  52.8 
 
 		 426 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  53.99 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  56.71 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  50.85 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  50.86 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  50.48 
 
 		 424 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  48.84 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  49.76 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  45.93 
 
 		 433 aa  335  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  44.05 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  39.04 
 
 		 423 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  38.8 
 
 		 423 aa  295  9e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  38.8 
 
 		 423 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  39.04 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  38.8 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  38.8 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  38.8 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  41.65 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  38.55 
 
 		 423 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  38.55 
 
 		 423 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  38.76 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  41.42 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  38.89 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.32 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.91 
 
 		 444 aa  286  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  38.86 
 
 		 439 aa  286  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  37.41 
 
 		 437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.12 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  39.53 
 
 		 440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  39.53 
 
 		 440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  39.53 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.32 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.95 
 
 		 443 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.5 
 
 		 450 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.09 
 
 		 429 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.72 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  37.84 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.86 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.76 
 
 		 448 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.66 
 
 		 440 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.94 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.52 
 
 		 451 aa  279  9e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  41.16 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>