More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5637 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 442 aa  887    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  84.91 
 
 		 424 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  84.43 
 
 		 424 aa  676    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  73.38 
 
 		 435 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  57.28 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  54.61 
 
 		 490 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  56.97 
 
 		 433 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  56.03 
 
 		 436 aa  475  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  57.64 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  56.54 
 
 		 433 aa  464  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  57.53 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  56.45 
 
 		 428 aa  455  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  56.87 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  56.84 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  56.05 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  51.68 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  51.07 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  55.8 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  51.08 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  53.11 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  55.63 
 
 		 466 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  50.12 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  53.43 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  56.02 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  52.11 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  51.68 
 
 		 470 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  50.83 
 
 		 439 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  49.52 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  51.42 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  50.59 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  48.71 
 
 		 442 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  52.21 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  48.34 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  52.21 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  52.21 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  52.21 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  52.21 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  52.21 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  52.21 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  52.45 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  48.84 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  51.55 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  49.65 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  52.45 
 
 		 432 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  52.45 
 
 		 432 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  49.18 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  50.12 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  49.3 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  49.53 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  48.94 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  47.4 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  49.53 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  54.61 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  48.69 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  48.67 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  50.49 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  49.88 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  49.63 
 
 		 409 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  50.49 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  48.29 
 
 		 412 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  48.63 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  50.73 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  45.95 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  45.95 
 
 		 426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  42.97 
 
 		 405 aa  340  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  44.89 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  38.15 
 
 		 421 aa  280  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  35.8 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  38.28 
 
 		 423 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0742  proton/sodium-glutamate symport protein  39.34 
 
 		 421 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000616985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  38.25 
 
 		 423 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  36.98 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  37.21 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  36.98 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  36.98 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  37.09 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  36.98 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  36.98 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  38 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  36.98 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  36.98 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  36.98 
 
 		 423 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  36.85 
 
 		 424 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  36.98 
 
 		 423 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  35.27 
 
 		 438 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  36.49 
 
 		 423 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  37.92 
 
 		 444 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  36.74 
 
 		 423 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  36.74 
 
 		 423 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  35.03 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  36.84 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  37.63 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  36.84 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  36.84 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  37.68 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  36.84 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  36.84 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  36.26 
 
 		 437 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  36.26 
 
 		 437 aa  270  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>