More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0008 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 439 aa  860    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  60.43 
 
 		 421 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  58.99 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  57.88 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  56.87 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  58.31 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  58.31 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  54.44 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  61.67 
 
 		 417 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  59.36 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  55.87 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  50.8 
 
 		 442 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  59.41 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  59.41 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  59.41 
 
 		 472 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  53.25 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  59.41 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  59.41 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  59.41 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  59.41 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  59.66 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  54.86 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  59.85 
 
 		 432 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  59.85 
 
 		 432 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  53.41 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  52.18 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  52.93 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  54.07 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  51.12 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  55.04 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  52.26 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  52.22 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  52.49 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  51.11 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  52.73 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  52.73 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
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NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  54.42 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
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NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  54.52 
 
 		 412 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  54.59 
 
 		 435 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  54.59 
 
 		 435 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  50.96 
 
 		 436 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  53.23 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  51.72 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  55.4 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
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NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  54.27 
 
 		 466 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  53.85 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
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NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  52.66 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
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NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  52.55 
 
 		 409 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
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NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  53.69 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  52.84 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  51.54 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  53.09 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  51.08 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  54.59 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  52.24 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  50.62 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  52.24 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  50.98 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  51.42 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  50.98 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  52.46 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  52.21 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  52.22 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  50.96 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  48.43 
 
 		 415 aa  358  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  42.61 
 
 		 422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  43.53 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  44.83 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  42.63 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  42.5 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  43.71 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  42.63 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  42.63 
 
 		 438 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  42.79 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  42.79 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  42.79 
 
 		 443 aa  309  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  38.66 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  38.66 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  38.66 
 
 		 423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  38.66 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.56 
 
 		 420 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  38.66 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  38.66 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  42.23 
 
 		 423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  42.93 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  42 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  42.03 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  42.03 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 423 aa  306  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  38.43 
 
 		 423 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  42.03 
 
 		 423 aa  306  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  42.23 
 
 		 423 aa  306  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  38.43 
 
 		 423 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  43.17 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  42.99 
 
 		 424 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  42.79 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  42.47 
 
 		 438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_0517  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.3 
 
 		 421 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.946656  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  40.59 
 
 		 443 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  42.68 
 
 		 438 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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